微波是指波长在1毫米~1米的范围内的电滋波，其频率介于高频电和激光之间，临床应用都是用共同的生物热效应，所不同之处在于高频电和激光是通过热传导形式组织致热，属于外部加热，所以温度高，使组织碳化，而微波则是以生物组织本身作为热源的内部加热，组织中的极性分子（主要为水分子）随微波频率高速转动，互相磨擦产生热量。
微波治疗仪基本用途就是微波理疗和微波治疗，已经非常普遍地运用于各级医疗机构。微波理疗是指将仪器产生的微波通过理疗头输出到待理疗的组织，由于微波能直接穿透到待治疗组织的内部，引起组织内的水分子、离子等高速旋转和振荡，从而产生大量热量。其基本机理就是通过提升人体局部组织的温度，使该组内的血管扩张，继而打通毛细血管，提高血液灌注。
因此微波理疗就是通过改善血液循环，促进炎症吸收和组织细胞的新陈代谢，具有消炎、消肿、除痛和修复受损细胞功能的作用； 微波治疗是指将微波治疗仪产生的微波能量，通过输出面积很小的治疗头输出到人体局部组织，由于输出的微波能量密度很高，能迅速将被接触的组织的蛋白凝固，使该组织蛋白变性坏死，具有无炭化、无溅射和创面可控的特点，因此被广泛地运用于妇科、皮肤科、耳鼻喉科的电烧手术中。
区别于红外线热疗仪器，微波治疗仪在使用上需要注意的地方很多，红外线热疗仪器由于是直接作用于人体的皮肤，通过加温皮肤来慢慢改善皮肤以内的人体组织的血液循环，所以治疗时如果发生烫伤也只是皮肤浅层的人体组织，微波治疗仪则不同，在仪器故障或者操作不当的条件下，如果发生烫伤的情况，则是从皮肤往里有一定深度的范围发生整体烫伤，所以使用微波治疗仪特别需要重视以下安全注意事项：
1、使用前检查理疗线与理疗头、理疗线与仪器的射频输出接头两部分是否牢固连接。
2、治疗时采用的功率大小要以温热舒适感为好，设置功率不能过高。以直径8公分的圆形理疗头为例，功率一般宜设置在8-12W，遇到炎症较重，或者脂肪较多的组织，建议适当降低微波功率。 3、不能用微波直接照射眼睛，其主要原因是由于人体眼球晶体内没有血管，吸收的微波能量不易扩散，容易导致温度过高所致的蛋白质变性，继而影响视力。
4、治疗鼻炎疾病时，微波理疗头应该在直接对准鼻炎病灶的同时，偏向下一些（即嘴的方向）。 5、不能用微波直接照射孕妇腹部。
6、佩戴心脏起搏器者要远离处于工作状态下的微波治疗仪。
7、植有金属部件的人体组织不能用微波直接照射，以免因灼伤组织。
8、对热不敏感者要小心使用，避免烫伤。
9、小孩使用需要有大人监护照顾。
10、育龄者不能用微波照射睾丸
11、不得随意配置非配套的理疗头，驻波比和输出场分布的不同，容易导致疗效差异或者灼伤。 12、专家建议，长期使用者每天不要超过30分钟。
