如何选择合适的逆转录酶?

康为世纪品牌馆

2012-09-29点击量:

    目前市面上有多种的逆转录酶,是不是让你感觉到眼花缭乱,无所适从呢?不过只要抓住了以下几个关键因素,问题就会迎刃而解了。

1RNase H活性和产物长度。逆转录酶自带RNase H活性,RNase H在逆转录实验过程中会降解RNA模板,进而影响逆转录产物的长度和产量。因此在全文库构建、需要克隆较长片段或者未知长度的DNA时,要得到完整的逆转录的产物长度,好选择无RNase H活性的逆转录酶,或者RNase H活性低的混合酶产品,医流商城提供的多个品牌的逆转录酶的转录产物可长达12kb以上,甚至高达20kbAMV逆转录酶和MMLV逆转录酶都有RNase H的活性,MMLV逆转录酶的RNase H活性比AMV弱。医流商城还提供基因工程突变的MMLV逆转录酶,去除了RNase H活性,有利于获得更多全长的cDNA,而对于已知较短片段,逆转录活性高、适应性强的AMV逆转录酶是不错的选择。

2.适温度。一般的逆转录酶在遇到mRNA复杂二级结构时往往会脱离模板,导致逆转录无法有效继续,得不到长的反应产物。提高反应温度有助于消除模板的二级结构,增加逆转录的特异性,减少错配。但是较高的反应温度可能导致酶工作效率的降低。AMV逆转录酶由于来源于禽类病毒,适温度42,耐受温度范围较宽,逆转录活性强。MMLV逆转录酶适温度37,经过基因工程的改造的热稳定MMLV逆转录酶可在较短时间(1-3.5hours)耐受50-60反应温度,不过反应温度越高耐受期也越短。来源于高温环境下的嗜热细菌的逆转录酶是耐热性高的酶,可长时间耐受高达70度的反应温度,即使困难的模板也可以迎刃而解。因此,如果你的模板GC含量高或者具有复杂的二级结构,可根据情况选择热稳定的逆转录在更高的温度(55-70)下反应能得到较好的结果。

3.灵敏性。如果你的模板量很少,如来自珍稀物种等极为珍贵的样品,或者是显微镜下才可见的微小寄生生物,那么就要选择灵敏度高的逆转录酶。逆转录酶不断在升级换代,检测起始模板的总RNA量的下限已低至pg级别,对高丰度管家基因甚至低到0.1pg起始总RNA即可检测到。对于样品量大的常规检测或者扩增,不必考虑灵敏性时,不妨选择逆转录酶活性高适应性强的逆转录酶。

4.保真度。逆转录酶通常不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,由逆转录酶催化合成的DNA错配率比较高,这可能也是病毒变异性高适应性强的原因之一。现在已经有校对功能的高保真逆转录酶推出,所以如果你想接着做表达和测序,高保真的逆转录酶就是你的佳选择了。

5.反应效率。一般来说,粗放、耐受性强的酶效率高,产量大,对于反应条件要求不高,很适合常规检测或者模板量大,长度较短的普通逆转录实验。而高保真、高灵敏度或者高温反应可能会影响反应效率。不过现在流行组合酶,将几种不同的逆转录酶混合以达到兼顾的效果。短的反应时间已经从常规的1小时左右缩短到10分钟。这对于科研不断提速,追求更快出结果的实验人员来讲是一个很好的消息。

6.价格比。产品价格是大家关心的问题之一。对于逆转录酶,需要留意不同品牌的酶的单位定义,有的产品每次反应需要200U的酶,有的则为几个单位,单位内涵不同。评估每次反应的成本,需要以一个包装能做的反应次数为准来判断。另外,有些性能出众的好产品价格不菲,所以不妨留意促销活动,趁价格非常划算之际,抓紧时间购买。

 

 

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