讲到自动核酸蛋白质层析仪，我们不得不对核酸与蛋白质有个大致了解，大家都知道，核酸和蛋白质是人体的主要组成成分，核酸是由许多核苷酸聚合成的生物大分子化合物，为生命的基本物质之一。核酸广泛存在于所有动物、植物细胞、微生物内、生物体内核酸常与蛋白质结合形成核蛋白。不同的核酸，其化学组成、核苷酸排列顺序等不同。根据化学组成不同，核酸可分为核糖核酸，简称RNA和脱氧核糖核酸，简称DNA。DNA是储存、复制和传递遗传信息的主要物质基础，RNA在蛋白质合成过程中起着重要作用，其中转移核糖核酸，简称tRNA，起着携带和转移活化氨基酸的作用；信使核糖核酸，简称mRNA，是合成蛋白质的范本；核糖体的核糖核酸，简称rRNA，是细胞合成蛋白质的主要场所。蛋白质就不用过多介绍了，蛋白质（protein）是生命的物质基础，没有蛋白质就没有生命。所以核酸与蛋白质有着密切关联，对核酸与蛋白质的的研究有很高的科学价值，比如亲子鉴定就需要DNA的对比，所以需要把核酸与蛋白质分离开来，便于单一研究。
而目前所用到的分离方法有多中，如沉淀分离法，溶剂萃取分离法，离子交换分离法，还有就是色谱分离。这里我们所提到的自动核酸蛋白质层析仪的主要就是用于核酸与蛋白质的分离，它的主要工作原理就是色谱分离法的原理。层析（chromatography）是“色层分析”的简称。利用各组分物理性质的不同，将多组分混合物进行分离及测定的方法。有吸附层析、分配层析两种。一般用于有机化合物、金属离子、氨基酸等的分析。层析利用物质在固定相与流动相之间不同的分配比例，达到分离目的的技术。层析对生物大分子如蛋白质和核酸等复杂的有机物的混合物的分离分析有极高的分辨力。
自动核酸蛋白质层析仪的主要构成是核酸蛋白检测仪，台式记录仪，恒流泵，自动部份收集器，层析柱：Φ1.0×40，Φ1.6×50，Φ2.5×60各一支，另外也可以配上梯度混合器，可以调节溶液混合速度以及输出流量，并可做出各种不同斜率的线形梯度。
