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Ion Proton™ Sequencer

HiSeq 2500

测序市场的领头羊Illumina公司将推出一款新的测序仪。这个名为HiSeq 2500的系统将让研究人员和临床医生能够在大约24小时内完成整个基因组的测序，即“一个基因组”。而在这个消息发布的几小时之前，Illumina的老对手，Life Technologis公司也宣布推出了Ion Proton测序仪，旨在内完成人类基因组的测序，耗资约为1000美元。

过去，获得结果的时间还不够快和数据分析，可谓进入临床的两大瓶颈。对于研究人员来说能同分析数据是测序仪进入临床的关键因素之一。新测序仪能在24小时内完成整个基因组的测序，正好解决了这个问题。新一代测序技术不再是大型实验室的专享，一些过去想都无法想象的研究方法，如今已触手可及--两大巨头在小型测序仪市场上的竞争再次打响，可谓功不可没。那么，这次推出的两款测序仪，同样是一个基因组，主要差别有哪些呢?

据Illumina公司的Flatley介绍，HiSeq 2500的价格将是74万美元(美国报价，不适合中国)，也可从现有的HiSeq 2000升级，费用是5万美元。仪器采用两种模式，既可在27小时内产生120 Gb，也可在标准的HiSeq运行中产生600 Gb。HiSeq 2500显然将延续和扩大Illumina在高端测序仪领域的优势。

Life Tech的新仪器Ion Proton只需要15万美元(2012年1月Life Tech网站新闻公布, 美国本土报价，不适合中国。有网友补充，15万美金是主机不带附属设备的，全部买齐大概要40万美金。)。虽然目前Life Tech还没有提供详细的数据，看来Ion Proton在主攻的个人型测序仪市场上将再度掀起热潮，因为在美国NIH可能削减经费的形势下，Ion Proton的价格可能会吸引相当一部分科学家。目前Ion PGM的通量从314芯片的几十Mb到316芯片的几百Mb，以及新上市的Ion 318芯片超过1GB。

Broad研究院基因组测序和分析项目的联合主管，同时也是Ion Proton系统的早期用户的Chad Nusbaum认为：Ion Proton系统的价格将是主要卖点。他觉得或许(两者)数据质量会有点差别，但不会太多。Ion Proton系统的低价格会吸引不少粉丝。对于Illumina的新仪器，他认为，速度快当然很好，但成本也是个考虑因素。(以上信息来自福布斯)不过毫无疑问，在高端测序仪市场已经占尽先机的Illumina并不会轻易放弃平价测序仪市场，我们期待不久的将来，Illumina还会再宣布Miseq的升级。早买仪器能早出结果早发文章，晚点买呢，或许能买到更先进的版本，但又怕等决定买时人家已经发表文章了，公布距离真正发售还有点时间，大家还Hold不Hold得住呢?

自此，两大测序巨头的测序竞赛再次升级。此前三家测序巨头的竞争，使得测序仪读取DNA数据的速度越来越快，速度提升之快已经超越了的“摩尔法则”对微处理器加速的预测。回合中，Illumina推出的Genome Analyzer，迅速占领了新一代测序的市场，先拨头筹。相比之下ABI推出的SOLiD虽然性能强大，可惜在单机高达50万美元起步的高端测序仪市场，还是稍晚了一步。ABI的转机出现在2010年，不过当时已不再是ABI，而是合并之后的Life Technologies。这年初，Ion Torrent公司一鸣惊人，推出了一款廉价小巧的半导体测序仪。Ion Torrent的创始人是Jonathan M. Rothberg，这个测序领域的传奇人物在2000-2007年间创立的454 公司推出了台新一代测序仪，被罗氏收购。2007年-2010年他成立Ion Torrent公司，几个月后，这家公司被Life Tech收购，Rothberg 成为Life Tech公司半导体测序部门的领头人。Ion PGM虽不是个上市的个人型测序仪，但因价格低廉、表现出色，获得了很好的市场反应，相比50万美元以上级别的超豪华设备，5-10万美元级别的Ion PGM更容易为普通实验室接受，无怪迅速成为当年卖的快的测序仪。Illumina随即推出价格在10万美元级别的个人型测序仪MiSeq。

短短五年的时间，个人基因组测序费用已降低了1000倍。测序技术发展之快，令人惊叹。

一个基因组，听上去很美，但也对数据分析提出了更高的挑战。一个，分析得过来么?费用如何?之前有专家预测，尽管千元基因组目标的实现指日可待，但对于测序后的数据分析，则可能还要再加两个零。测序仪的不断升级也意味着，另一个数据分析市场的大门敞开了。学生物的将来不学生物信息学恐怕不行了!有网友打趣，也许再过十年去面试的时候，电子简历后面还要附上自己的全基因组序列。

作者：keeii 点击：次