2、分析生物大分子如：DNA、RNA、抗原、癌基因表达产物等物质与细胞增殖周期的关系，进行染色体核型分析，并可纯化X或Y染色体。
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1、DNA倍体含量测定是鉴别良、恶性肿瘤的特异指标。
2、近年来已应用DNA倍体测定技术，对白血病、淋巴瘤及肺癌、膀胱癌、前列腺癌等多种实体瘤细胞进行探测。
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1、研究细胞周期或DNA倍体与细胞表面受体及抗原表达的关系；
4、免疫缺陷病如艾滋病的诊断；
5、器官移植后的免疫学监测等。
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1、血液细胞的分类、分型，造血细胞分化的研究，血细胞中各种酶的定量分析，如过氧化物酶、非特异性酯酶等；
2、用NBT及DNA双染色法可研究白血病细胞分化成熟与细胞增殖周期变化的关系，检测母体血液中Rh(+)或抗D抗原阳性细胞，以了解胎儿是否可能因Rh血型不合而发生严重溶血；
3、检测血液中循环免疫复合物可以诊断自身免疫性疾病，如红斑狼疮等。
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1、检测药物在细胞中的分布，研究药的作用机制，亦可用于筛选新药，如化疗药物对肿瘤的凋亡机制，可通过测DNA凋亡峰，Bcl-2凋亡调节蛋白等。
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